Die Hafenschule wurde 1805 vom Vareler Graf Wilhelm Gustav Friedrich Bentinck errichtet. Er schenkte es seiner zweiten Ehefrau ”Köselmakersdeern” Sarah Margarethe aus Steinhausen als Witwensitz. 1835 pachtete Garlich Suhren aus Jeringhave das Schloss. Während des Zweiten Weltkrieges wurde das Schloss 1940 zu einer Dienststelle der Marine und diente ab 1945 den Kanadischen Besatzungstruppen als Standort. Zudem wurde das Schloss zur ersten neuen Heimat vieler Menschen, die aus ihrer alten Heimat in Schlesien und Pommern vertrieben wurden. Seit 1947 ist das Schloss eine Schule. Die Stadt Varel pachtete es, um dort eine Grundschule für fast 150 Kinder einzurichten. Später wurde aus der Grundschule eine Volksschule – das ist so etwas wie heute die Hauptschule. Hier sind die Kinder von der ersten bis zur achten und später auch neunten Klasse in die Schule gegangen. 1964 wurde der „Neubau“, die Turnhalle und das Hausmeisterhaus errichtet.Seit 1972 ist die Hafenschule wieder eine Grundschule – zeitweise auch mit zwei Klassen in jedem Jahrgang. Und seit August 2009 ist die Hafenschule die erste Grundschule in Varel, die als Ganztagsschule „Bis 3 dabei“ ist.